Chromatin accessibility identifies diversity in mesenchymal stem cells from different tissue origins.
Ho YT., Shimbo T., Wijaya E., Ouchi Y., Takaki E., Yamamoto R.
การศึกษาในสัตว์ทดลอง ตีพิมพ์ในวารสาร Sci Rep ปี 2018 — สรุปอัตโนมัติจากบทคัดย่อ PubMed
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
- ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
- ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
- ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
- ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
- กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง
ข้อมูลหน้านี้ดึงมาจากฐานข้อมูล PubMed โดยตรง คำอธิบายภาษาไทยเป็นสรุปอัตโนมัติจากข้อมูลบรรณานุกรมและบทคัดย่อ ไม่ใช่การแปลทั้งฉบับ และไม่ใช่คำแนะนำทางการแพทย์
- ประเภทการศึกษา
- การศึกษาในสัตว์ทดลอง
- วารสาร
- Sci Rep (2018)
- ประเทศ
- England
- จำนวนผู้เข้าร่วม (จากบทคัดย่อ)
- —
- แหล่งข้อมูล
- PubMed
- PMID
- 30531792
- DOI
- 10.1038/s41598-018-36057-0
บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)
Mesenchymal stem cells (MSCs), which can differentiate into tri-lineage (osteoblast, adipocyte, and chondrocyte) and suppress inflammation, are promising tools for regenerative medicine. MSCs are phenotypically diverse based on their tissue origins. However, the mechanisms underlying cell-type-specific gene expression patterns are not fully understood due to the lack of suitable strategy to identify the diversity. In this study, we investigated gene expression programs and chromatin accessibilities of MSCs by whole-transcriptome RNA-seq analysis and an assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq). We isolated MSCs from four tissues (femoral and vertebral bone marrow, adipose tissue, and lung) and analysed their molecular signatures. RNA-seq identified the expression of MSC markers and both RNA-seq and ATAC-seq successfully clustered the MSCs based on their tissue origins. Interestingly, clustering based on tissue origin was more accurate with chromatin accessibility signatures than with transcriptome profiles. Furthermore, we identified transcription factors potentially involved in establishing cell-type specific chromatin structures. Thus, epigenome analysis is useful to analyse MSC identity and can be utilized to characterize these cells for clinical use.
สิ่งที่งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์
- • งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์ว่า SVF เป็นการรักษาที่ได้รับการรับรอง หรือใช้แทนการรักษามาตรฐานได้
- • เป็นการศึกษาก่อนคลินิก ผลในสัตว์ทดลองหรือห้องปฏิบัติการไม่สามารถนำมาสรุปผลในมนุษย์ได้
ระดับหลักฐาน
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
ดูวิธีจัดระดับหลักฐานดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง
กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้