Comparative analysis of the human hepatic and adipose tissue transcriptomes during LPS-induced inflammation leads to the identification of differential biological pathways and candidate biomarkers

มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

Background Insulin resistance (IR) is accompanied by chronic low grade systemic inflammation, obesity, and deregulation of total body energy homeostasis. We induced inflammation in adipose and liver tissues in vitro in order to mimic inflammation in vivo with the aim to identify tissue-specific processes implicated in IR and to find biomarkers indicative for tissue-specific IR. Methods Human adipose and liver tissues were cultured in the absence or presence of LPS and DNA Microarray Technology was applied for their transcriptome analysis. Gene Ontology (GO), gene functional analysis, and prediction of genes encoding for secretome were performed using publicly available bioinformatics tools (DAVID, STRING, SecretomeP). The transcriptome data were validated by proteomics analysis of the inflamed adipose tissue secretome. Results LPS treatment significantly affected 667 and 483 genes in adipose and liver tissues respectively. The GO analysis revealed that during inflammation adipose tissue, compared to liver tissue, had more significantly upregulated genes, GO terms, and functional clusters related to inflammation and angiogenesis. The secretome prediction led to identification of 399 and 236 genes in adipose and liver tissue respectively. The secretomes of both tissues shared 66 genes and the remaining genes were the differential candidate biomarkers indicative for inflamed adipo

ระดับหลักฐาน

มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้