Identification of the putative regulatory regions and candidate genes associated with backfat thickness and intramuscular fat content traits in Xiang pigs
Chen X., Zheng Y., Hu F., Liu X., Wang W., Qi F.
การศึกษาในสัตว์ทดลอง ตีพิมพ์ในวารสาร BMC Genomics ปี 2025 — สรุปอัตโนมัติจากบทคัดย่อ PubMed
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
- ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
- ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
- ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
- ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
- กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง
ข้อมูลหน้านี้ดึงมาจากฐานข้อมูล PubMed โดยตรง คำอธิบายภาษาไทยเป็นสรุปอัตโนมัติจากข้อมูลบรรณานุกรมและบทคัดย่อ ไม่ใช่การแปลทั้งฉบับ และไม่ใช่คำแนะนำทางการแพทย์
- ประเภทการศึกษา
- การศึกษาในสัตว์ทดลอง
- วารสาร
- BMC Genomics (2025)
- จำนวนผู้เข้าร่วม (จากบทคัดย่อ)
- —
- แหล่งข้อมูล
- Europe PMC
- PMID
- 40775679
- PMCID
- PMC12333138
- DOI
- 10.1186/s12864-025-11860-y
- จำนวนการอ้างอิง
- 1
บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)
Backfat thickness (BFT) and intramuscular fat (IMF) content reflect fat deposition and meat quality in pigs. Numerous genetic variations contribute to differences in BFT and IMF for different pig breeds. However, limited information is available on the genetic variants associated with IMF deposition in Xiang pigs. To identify the putative regulatory regions and candidate genes associated with BFT and IMF traits in Xiang pigs, we integrated the whole genomic DNA genotyping and RNA-sequencing data in Longissimus thoracis muscle from F2 individuals of Large White × Xiang pig cross and performed the expression quantitative trait loci (eQTL) analyses. We identified a total of 64,419 significant cis-variant-eGene, including 33,288 eSNPs, 7,910 eInDels, and 5,940 eSVs. Among them, 1,156 cis-eQTL loci overlapped with QTL for IMF and BFT, affecting the expressions of 541 genes, including 54 transcription factors. Enrichment analysis revealed that key candidate genes were significantly associated with lipid metabolism pathways, such as mTOR and PPAR signaling. Overlap analysis demonstrated that several eQTLs exhibited dual regulatory effects on gene expression. Notable eQTL hotspots included eSNP 12:52760182_T, eInDel 2:6807484-6,807,485, and three eSV sites, with the P2RY6 gene significantly associated with multiple variants. Our results indicated that many regions across the pig genome
สิ่งที่งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์
- • งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์ว่า SVF เป็นการรักษาที่ได้รับการรับรอง หรือใช้แทนการรักษามาตรฐานได้
- • เป็นการศึกษาก่อนคลินิก ผลในสัตว์ทดลองหรือห้องปฏิบัติการไม่สามารถนำมาสรุปผลในมนุษย์ได้
ระดับหลักฐาน
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
ดูวิธีจัดระดับหลักฐานดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง
กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้