Large-scale methylation domains mark a functional subset of neuronally expressed genes
Schroeder DI., Lott P., Korf I., LaSalle JM.
การศึกษาในห้องปฏิบัติการ ตีพิมพ์ในวารสาร Genome Res ปี 2011 — สรุปอัตโนมัติจากบทคัดย่อ PubMed
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
- ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
- ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
- ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
- ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
- กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง
ข้อมูลหน้านี้ดึงมาจากฐานข้อมูล PubMed โดยตรง คำอธิบายภาษาไทยเป็นสรุปอัตโนมัติจากข้อมูลบรรณานุกรมและบทคัดย่อ ไม่ใช่การแปลทั้งฉบับ และไม่ใช่คำแนะนำทางการแพทย์
- ประเภทการศึกษา
- การศึกษาในห้องปฏิบัติการ
- วารสาร
- Genome Res (2011)
- จำนวนผู้เข้าร่วม (จากบทคัดย่อ)
- —
- แหล่งข้อมูล
- Europe PMC
- PMID
- 21784875
- PMCID
- PMC3202276
- DOI
- 10.1101/gr.119131.110
- จำนวนการอ้างอิง
- 74
บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)
DNA methylation is essential for embryonic and neuronal differentiation, but the function of most genomic DNA methylation marks is poorly understood. Generally the human genome is highly methylated (>70%) except for CpG islands and gene promoters. However, it was recently shown that the IMR90 human fetal lung fibroblast cells have large regions of the genome with partially methylated domains (PMDs, 70% average methylation). Using bisulfite conversion followed by high-throughput sequencing (MethylC-seq), we discovered that human SH-SY5Y neuronal cells also contain PMDs. We developed a novel hidden Markov model (HMM) to computationally map the genomic locations of PMDs in both cell types and found that autosomal PMDs can be >9 Mb in length and cover 41% of the IMR90 genome and 19% of the SH-SY5Y genome. Genomic regions marked by cell line specific PMDs contain genes that are expressed in a tissue-specific manner, with PMDs being a mark of repressed transcription. Genes contained within N-HMDs (neuronal HMDs, defined as a PMD in IMR90 but HMD in SH-SY5Y) were significantly enriched for calcium signaling, synaptic transmission, and neuron differentiation functions. Autism candidate genes were enriched within PMDs and the largest PMD observed in SH-SY5Y cells marked a 10 Mb cluster of cadherin genes with strong genetic association to autism. Our results suggest that these large-scal
สิ่งที่งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์
- • งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์ว่า SVF เป็นการรักษาที่ได้รับการรับรอง หรือใช้แทนการรักษามาตรฐานได้
- • เป็นการศึกษาก่อนคลินิก ผลในสัตว์ทดลองหรือห้องปฏิบัติการไม่สามารถนำมาสรุปผลในมนุษย์ได้
ระดับหลักฐาน
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
ดูวิธีจัดระดับหลักฐานดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง
กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้