Next-generation sequencing in neuropathologic diagnosis of infections of the nervous system

มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

Objective To determine the feasibility of next-generation sequencing (NGS) microbiome approaches in the diagnosis of infectious disorders in brain or spinal cord biopsies in patients with suspected CNS infections. Methods In a prospective pilot study, we applied NGS in combination with a new computational analysis pipeline to detect the presence of pathogenic microbes in brain or spinal cord biopsies from 10 patients with neurologic problems indicating possible infection but for whom conventional clinical and microbiology studies yielded negative or inconclusive results. Results Direct DNA and RNA sequencing of brain tissue biopsies generated 8.3 million to 29.1 million sequence reads per sample, which successfully identified with high confidence the infectious agent in 3 patients for whom validation techniques confirmed the pathogens identified by NGS. Although NGS was unable to identify with precision infectious agents in the remaining cases, it contributed to the understanding of neuropathologic processes in 5 others, demonstrating the power of large-scale unbiased sequencing as a novel diagnostic tool. Clinical outcomes were consistent with the findings yielded by NGS on the presence or absence of an infectious pathogenic process in 8 of 10 cases, and were noncontributory in the remaining 2. Conclusions NGS-guided metagenomic studies of brain, spinal cord, or meningeal biop

ระดับหลักฐาน

มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้