Promoter-Adjacent DNA Hypermethylation Can Downmodulate Gene Expression: TBX15 in the Muscle Lineage
Ehrlich KC., Lacey M., Baribault C., Sen S., Esteve PO., Pradhan S.
การศึกษาในห้องปฏิบัติการ ตีพิมพ์ในวารสาร Epigenomes ปี 2022 — สรุปอัตโนมัติจากบทคัดย่อ PubMed
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
- ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
- ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
- ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
- ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
- กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง
ข้อมูลหน้านี้ดึงมาจากฐานข้อมูล PubMed โดยตรง คำอธิบายภาษาไทยเป็นสรุปอัตโนมัติจากข้อมูลบรรณานุกรมและบทคัดย่อ ไม่ใช่การแปลทั้งฉบับ และไม่ใช่คำแนะนำทางการแพทย์
- ประเภทการศึกษา
- การศึกษาในห้องปฏิบัติการ
- วารสาร
- Epigenomes (2022)
- จำนวนผู้เข้าร่วม (จากบทคัดย่อ)
- —
- แหล่งข้อมูล
- Europe PMC
- PMID
- 36547252
- PMCID
- PMC9778270
- DOI
- 10.3390/epigenomes6040043
- จำนวนการอ้างอิง
- 8
บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)
TBX15, which encodes a differentiation-related transcription factor, displays promoter-adjacent DNA hypermethylation in myoblasts and skeletal muscle (psoas) that is absent from non-expressing cells in other lineages. By whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) and enzymatic methyl-seq (EM-seq), these hypermethylated regions were found to border both sides of a constitutively unmethylated promoter. To understand the functionality of this DNA hypermethylation, we cloned the differentially methylated sequences (DMRs) in CpG-free reporter vectors and tested them for promoter or enhancer activity upon transient transfection. These cloned regions exhibited strong promoter activity and, when placed upstream of a weak promoter, strong enhancer activity specifically in myoblast host cells. In vitro CpG methylation targeted to the DMR sequences in the plasmids resulted in 86−100% loss of promoter or enhancer activity, depending on the insert sequence. These results as well as chromatin epigenetic and transcription profiles for this gene in various cell types support the hypothesis that DNA hypermethylation immediately upstream and downstream of the unmethylated promoter region suppresses enhancer/extended promoter activity, thereby downmodulating, but not silencing, expression in myoblasts and certain kinds of skeletal muscle. This promoter-border hypermethylation was not found in cell
สิ่งที่งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์
- • งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์ว่า SVF เป็นการรักษาที่ได้รับการรับรอง หรือใช้แทนการรักษามาตรฐานได้
- • เป็นการศึกษาก่อนคลินิก ผลในสัตว์ทดลองหรือห้องปฏิบัติการไม่สามารถนำมาสรุปผลในมนุษย์ได้
ระดับหลักฐาน
หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป
ดูวิธีจัดระดับหลักฐานดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง
กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้