Regulatory modules of human thermogenic adipocytes: functional genomics of large cohort and Meta-analysis derived marker-genes

มีงานวิจัยในมนุษย์ที่มีคุณภาพค่อนข้างสูงเมื่อเทียบกับหัวข้ออื่นในฐานข้อมูลนี้ เช่น RCT หรือ Systematic Review หลายฉบับ แต่ไม่ได้หมายความว่าเป็นการรักษามาตรฐานหรือได้รับการรับรอง

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

Background Recently, ProFAT and BATLAS studies identified brown and white adipocytes marker genes based on analysis of large databases. They offered scores to determine the thermogenic status of adipocytes using the gene-expression data of these markers. In this work, we investigated the functional context of these genes. Results Gene Set Enrichment Analyses (KEGG, Reactome) of the BATLAS and ProFAT marker-genes identified pathways deterministic in the formation of brown and white adipocytes. The collection of the annotated proteins of the defined pathways resulted in expanded white and brown characteristic protein-sets, which theoretically contain all functional proteins that could be involved in the formation of adipocytes. Based on our previously obtained RNA-seq data, we visualized the expression profile of these proteins coding genes and found patterns consistent with the two adipocyte phenotypes. The trajectory of the regulatory processes could be outlined by the transcriptional profile of progenitor and differentiated adipocytes, highlighting the importance of suppression processes in browning. Protein interaction network-based functional genomics by STRING, Cytoscape and R-Igraph platforms revealed that different biological processes shape the brown and white adipocytes and highlighted key regulatory elements and modules including GAPDH-CS, DECR1, SOD2, IL6, HRAS, MTOR,

ระดับหลักฐาน

มีงานวิจัยในมนุษย์ที่มีคุณภาพค่อนข้างสูงเมื่อเทียบกับหัวข้ออื่นในฐานข้อมูลนี้ เช่น RCT หรือ Systematic Review หลายฉบับ แต่ไม่ได้หมายความว่าเป็นการรักษามาตรฐานหรือได้รับการรับรอง

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้