The RNA binding protein ZFP36L2 displays tissue-selective mRNA targeting in mice

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

ZFP36L2 (zinc finger protein 36 like 2, C3H type-ZFP) is an RNA-binding protein targeting transcripts rich in adenine-uridine elements (AREs). Previous transcriptomic analysis suggested that ZFP36L2 displays a distinct transcript preference or 'specific activity'. However, this analysis was restricted to a few tissues. Here, using experimental data in multiple tissues we detected a remarkable transcript selectivity depending on the tissue. Given that ZFP36L2 accelerates the degradation of specific ARE-transcripts upon binding, we obtained differential expression transcriptomic data on a Zfp36l2 knock-out mouse model to delve into the mechanisms governing this tissue-specific targeting. Transcriptomic analyzes of up-regulated ARE-transcripts in six tissues, lung, liver, bone marrow, spleen, kidney, and ovary of the Zfp36l2-deficient mouse confirmed that there is high tissue preference in ZFP36L2 targets. We observed only one common up-regulated gene, Apol11b, among these six different tissues. However, we do observe common trends, specifically an enrichment in protein coding genes in the up-regulated genes, consistent with these RBP primarily targeting genes on their 3' UTRs. Interestingly, we observed a significant increase in the proportion of IgV (immunoglobulin) genes being up-regulated. We further performed eCLIP (Enhanced Cross-Linking&ImmunoPreciptation) on a mouse cell l

ระดับหลักฐาน

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้