Splicing across adipocyte differentiation is highly dynamic and impacted by the metabolic phenotype

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

A better understanding of gene regulation in metabolically unhealthy adipose tissue can provide insights into the mechanisms underlying adipose tissue dysfunction. We used RNA-seq data from a differentiation time course of lean individuals, individuals with obesity, and individuals with obesity and T2D to characterize alternative splicing in adipocyte function. Splicing was highly dynamic across adipocyte differentiation, and the dynamics of splicing were impacted by metabolic phenotype. There was little overlap between genes that were differentially spliced and those that were differentially expressed, positioning alternative splicing as an independent regulatory mechanism whose impact would be missed when looking at gene expression changes alone. We integrated our splicing results with GWAS for BMI and T2D, and found that T2D-associated variants were enriched in regions that were differentially spliced in early differentiation. These findings provide insight into the role of splicing in adipocyte differentiation and serve as a resource to guide variant-to-function studies.

ระดับหลักฐาน

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้