YWHAZ and TBP are potential reference gene candidates for qPCR analysis of response to radiation therapy in colorectal cancer
Kim S., Park JY., Lee HW., Bae SU., Kim KE., Byun SJ.
การศึกษาไปข้างหน้า ตีพิมพ์ในวารสาร Sci Rep ปี 2023 — สรุปอัตโนมัติจากบทคัดย่อ PubMed
มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้
- ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
- ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
- ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
- ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
- กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง
ข้อมูลหน้านี้ดึงมาจากฐานข้อมูล PubMed โดยตรง คำอธิบายภาษาไทยเป็นสรุปอัตโนมัติจากข้อมูลบรรณานุกรมและบทคัดย่อ ไม่ใช่การแปลทั้งฉบับ และไม่ใช่คำแนะนำทางการแพทย์
- ประเภทการศึกษา
- การศึกษาไปข้างหน้า
- วารสาร
- Sci Rep (2023)
- จำนวนผู้เข้าร่วม (จากบทคัดย่อ)
- —
- แหล่งข้อมูล
- Europe PMC
- PMID
- 37558778
- PMCID
- PMC10412564
- DOI
- 10.1038/s41598-023-39488-6
- จำนวนการอ้างอิง
- 6
บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)
The expression profiles of conventional reference genes (RGs), including ACTB and GAPDH, used in quantitative real-time PCR (qPCR), vary depending on tissue types and environmental conditions. We searched for suitable RGs for qPCR to determine the response to radiotherapy in colorectal cancer (CRC) cell lines, organoids, and patient-derived tissues. Ten CRC cell lines (Caco-2, COLO 205, DLD-1, HCT116, HCT-15, HT-29, RKO, SW1116, SW480, and SW620) and organoids were selected and irradiated with 2, 10 or 21 grays (Gy) based on the previous related studies conducted over the last decade. The expression stability of 14 housekeeping genes (HKGs; ACTB, B2M, G6PD, GAPDH, GUSB, HMBS, HPRT1, IPO8, PGK1, PPIA, TBP, TFRC, UBC, and YWHAZ) after irradiation was evaluated using RefFinder using raw quantification cycle (Cq) values obtained from samples before and after irradiation. The expression stability of HKGs were also evaluated for paired fresh frozen tissues or formalin-fixed, paraffin-embedded samples obtained from CRC patients before and after chemoradiotherapy. The expression of YWHAZ and TBP encoding 14-3-3-zeta protein and TATA-binding protein were more stable than the other 12 HKGs in CRC cell lines, organoids, and patient-derived tissues after irradiation. The findings suggest that YWHAZ and TBP are potential RG candidates for normalizing qPCR results in CRC radiotherapy experim
สิ่งที่งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์
- • งานวิจัยนี้ไม่ได้พิสูจน์ว่า SVF เป็นการรักษาที่ได้รับการรับรอง หรือใช้แทนการรักษามาตรฐานได้
ระดับหลักฐาน
มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้
ดูวิธีจัดระดับหลักฐานดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง
กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้