2249 : Gene expression signatures of acute respiratory syncytial virus infection in pediatric patients reveals insight into clinical pathogenesis

มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

OBJECTIVES/SPECIFIC AIMS: Respiratory viruses cause enormous medical burden, yet many of the specific virus and host genetic factors that impact pathogenesis are still largely unknown or poorly understood. To better understand the drivers of both acute clinical pathogenesis and long-term impacts, such as the development of asthma, we investigated the host response to respiratory syncytial virus (RSV) infections in pediatric patients. METHODS/STUDY POPULATION: We collected nasopharyngeal swabs from 32 pediatric patients with acute RSV infection. The swabs represented a mixed cell population including epithelial and immune cells at the active site of infection. Unbiased RNA sequencing with ribosomal RNA depletion allowed the simultaneous detection of host gene expression and RSV infection. We sequenced samples 2×75 bp on an Illumina NextSeq 500. Sequences were mapped to the human genome using the TopHat 2 aligner and FPKM estimation of reference genes and transcripts and assembly of novel transcripts were conducted with Cufflinks 2. RESULTS/ANTICIPATED RESULTS: During acute RSV infection we identified 7343 genes that were significantly expressed. Pathway analysis using KEGG revealed significant upregulation of pathways involved in innate immune response infection, ribosome function, oxidative phosphorylation, spliceosome and autoimmune disorders. We found high levels of innate im

ระดับหลักฐาน

มีหลักฐานในมนุษย์ระยะต้น เช่น case series หรือกลุ่มตัวอย่างขนาดเล็ก ที่กำลังสำรวจประโยชน์ที่เป็นไปได้

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้