Paradigms, innovations, and biological applications of RNA velocity: a comprehensive review

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

Single-cell RNA sequencing enables unprecedented insights into cellular heterogeneity and lineage dynamics. RNA velocity, by modeling the temporal relationship between spliced and unspliced transcripts, extends this capability to predict future transcriptional states and uncover the directionality of cellular transitions. Since the introduction of foundational frameworks such as Velocyto and scVelo, an expanding array of computational tools has emerged, each based on distinct biophysical assumptions and modeling paradigms. To provide a structured overview of this rapidly evolving field, we categorize RNA velocity models into three classes: steady-state methods, trajectory methods, and state extrapolation methods, according to their underlying approaches to transcriptional kinetics inference. For each category, we systematically analyze both the overarching principles and the individual methods, comparing their assumptions, kinetic models, and computational strategies and assessing their respective strengths and limitations. To demonstrate the biological utility of these tools, we summarize representative applications of RNA velocity across developmental biology and diseased microenvironments. We further introduce emerging extensions of RNA velocity methods that go beyond classical splicing kinetics. Finally, we discuss existing limitations regarding model assumptions, preproces

ระดับหลักฐาน

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้