Time-course transcriptome analysis of human cellular reprogramming from multiple cell types reveals the drastic change occurs between the mid phase and the late phase

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

Background Human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) have been attempted for clinical application with diverse iPSCs sources derived from various cell types. This proposes that there would be a shared reprogramming route regardless of different starting cell types. However, the insights of reprogramming process are mostly restricted to only fibroblasts of both human and mouse. To understand molecular mechanisms of cellular reprogramming, the investigation of the conserved reprogramming routes from various cell types is needed. Particularly, the maturation, belonging to the mid phase of reprogramming, was reported as the main roadblock of reprogramming from human dermal fibroblasts to hiPSCs. Therefore, we investigated first whether the shared reprogramming routes exists across various human cell types and second whether the maturation is also a major blockage of reprogramming in various cell types. Results We selected 3615 genes with dynamic expressions during reprogramming from five human starting cell types by using time-course microarray dataset. Then, we analyzed transcriptomic variances, which were clustered into 3 distinct transcriptomic phases (early, mid and late phase); and greatest difference lied in the late phase. Moreover, functional annotation of gene clusters classified by gene expression patterns showed the mesenchymal-epithelial transition from day 0 to 3,

ระดับหลักฐาน

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้