Transcription outcome of promoters enriched in histone variant H3.3 defined by positioning of H3.3 and local chromatin marks.

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

• ระดับ A · หลักฐานทางคลินิกค่อนข้างแข็งแรง
• ระดับ B · หลักฐานทางคลินิกที่กำลังเติบโตและมีสัญญาณเชิงบวก
• ระดับ C · งานวิจัยในมนุษย์ระยะต้นที่กำลังสำรวจประโยชน์
• ระดับ D · รากฐานทางวิทยาศาสตร์จากห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง
• กำลังศึกษาเพิ่มเติม · หัวข้อใหม่ที่นักวิจัยกำลังสำรวจอย่างต่อเนื่อง

บทคัดย่อ (ต้นฉบับภาษาอังกฤษ)

Replication-independent histone variant H3.3 is incorporated into distinct genomic regions including promoters. However topology of promoter-associated H3.3 in relation to chromatin modifications and transcriptional outcome is not known, providing no insight on any distinction between H3.3-containing active and inactive promoters. Here, we report algorithms providing information on gene expression status as a function of density and position of multiple chromatin marks on promoters. We identify a relationship between promoter enrichment in epitope-tagged H3.3 or its canonical isoform H3.2 and corresponding transcriptional outcomes, as a function of sub-promoter positioning of DNA methylation and H3K4me3, H3K9me3 and H3K27me3. We identify a low-frequency configuration of H3.3 and H3K9me3 co-occupancy associated with transcriptional activity, while H3.3 and H3K27me3 promoters are invariably inactive. We unveil H3.3 and DNA methylated promoters whose transcription outcome depends on H3.3 sub-promoter positioning. Our results indicate how spatially restricted positioning of H3.3 may add another layer of transcription regulation.

ระดับหลักฐาน

หลักฐานจากการศึกษาในห้องปฏิบัติการและสัตว์ทดลอง เป็นรากฐานที่ช่วยให้เข้าใจกลไกและศักยภาพก่อนการศึกษาในมนุษย์ต่อไป

ดูงานวิจัยทั้งหมดที่เกี่ยวข้อง

กรองห้องสมุดงานวิจัยด้วยชื่อเรื่อง ชื่อผู้เขียน หรือปีที่ตีพิมพ์ของงานวิจัยนี้